Себестоимость  реализованной продукции за отчетный период составила 39,1 млрд рублей. При этом затраты на производство электроэнергии (мощности) на внутреннем рынке составили 10,7 млрд рублей (27,4%), на покупку электроэнергии (мощности) на внутреннем рынке – 25,4 млрд рублей (65,0%), импорт электроэнергии – 1,9 млрд рублей (4,9%).  
Валовая прибыль ОАО «ИНТЕР РАО ЕЭС» составила 7,7 млрд рублей, прибыль от продаж - 2,1 млрд. рублей.
Убыток до налогообложения составил 1,1 млрд рублей, чистый убыток ОАО «ИНТЕР РАО ЕЭС» по итогам 12 месяцев 2009 г. - 1,2 млрд рублей.
Основными факторами, повлиявшими на финансовый результат, стали отрицательные курсовые разницы, зафиксированные по обязательствам общества, выраженным в иностранной валюте, существенное увеличение стоимостных параметров заимствований компании в 2009 г., создание резервов под обеспечение финансовых вложений компании в ряд своих дочерних и зависимых компаний, а также убытки, связанные с трансграничными перетоками между Россией и Казахстаном.
Совокупные активы ОАО «ИНТЕР РАО ЕЭС» в течение 12 месяцев 2009 г. выросли на 16,7 млрд рублей (19%) и на 31 декабря 2009 г. составили 103,5 млрд рублей. Из них стоимость внеоборотных активов составила 76,0 млрд рублей (прирост – 19,4 млрд рублей, или 34%).
Рост внеоборотных активов связан с реализацией «ИНТЕР РАО ЕЭС» масштабной инвестиционной программы по строительству новых и техническому перевооружению действующих генерирующих мощностей. В частности, объем незавершенного строительства в течение 12 месяцев 2009 г. увеличился на 9,9 млрд рублей (149%)  - до 16,5 млрд рублей. в связи с реализацией основных инвестиционных проектов по строительству 2-го блока Ивановских ПГУ в объеме 2-х ПГУ-325 МВт, 2-го энергоблока Калининградской ТЭЦ-2, 2-ой очереди Сочинской ТЭС.
Кроме этого увеличилась сумма долгосрочных вложений на 5,5 млрд рублей (40%) до 19,1 млрд рублей, существенная доля которых связана с исполнением инвестиционных обязательств ОАО «ИНТЕР РАО ЕЭС», возникших в ходе приватизации ЗАО «Молдавская ГРЭС», направленных на модернизацию и реабилитацию основного оборудования станции.
При этом оборотные активы с января по декабрь 2009 г. уменьшились на 2,7 млрд рублей (9%) - до 27,4 млрд рублей, что вызвано сокращением дебиторской задолженности на 2,6 млрд рублей.
ОАО «ИНТЕР РАО ЕЭС» ведет активную претензионно-исковую деятельность. По итогам 2009 г. создан резерв по сомнительной задолженности в объеме 261,3 млн рублей (при этом в 2008 г. резерв не создавался). Всего в 2009 г. было удовлетворено 63 иска о взыскании дебиторской задолженности, предъявленных компанией ОАО «ИНТЕР РАО ЕЭС», на общую сумму 1,01 млрд рублей. В настоящее время в производстве арбитражных судов находится 15 исков на общую сумму 341,5 млн рублей.
Несмотря на увеличение совокупного объема долговых заимствований по состоянию на 31 декабря 2009 г. на 67% до 25,2 млрд рублей, структура кредитного портфеля существенным образом изменилась в сторону долгосрочных кредитов и по итогам 2009 г. они составили 86,9% против 53,1% на начала года.